Первое упоминание деревни Ивонино относится к 1678 г., когда описание отметило здесь двор с 8 холопами московского дворянина А. Ф. Болтина. Крестьянских дворов к этому времени в вотчине не было. Сведений о первом известном владельце деревни сохранилось немного - в разрядах он назван лишь раз - в качестве томского воеводы.

По данным "Экономических примечаний" конца XVIII в. Ивонино принадлежало Наталье Ивановне Нарышкиной и здесь имелось 2 двора, где зафиксировано 18 душ обоего пола. По сведениям 1852 г. деревня Ивонино - из одного двора, где было 5 мужчин и 7 женщин, находилась во владении действительного статского советника Петра Петровича Бекетова. Статистика 1890 г. сообщает, что в Ивонине было 25 жителей.

Перепись 1926 г. зафиксировала в Ивонино 16 крестьянских хозяйств и 86 человек. Спустя шесть десятилетий, по материалам 1989 г., численность постоянного населения сократилась до 28 человек. Всего же в деревне было отмечено 34 хозяйства.

О. А. Шватченко, Л. Г. Сапрыкина